Jurusan S.1 Pendidikan Bahasa Arab (PBA) IAIN Pekalongan telah terakreditasi A berdasarkan keputusan BAN PT No.555/SK/BAN-PT/Akred/S/II/2018 tertanggal 20 Februari 2018. Jurusan S1 PBA ini mulai di buka pada tahun akademik 2009/2010 dengan Ketua Jurusan yaitu Dr. Muhamad Jaeni, M.Pd., M.Ag dan Sekretaris Jurusan Moh. Nurul Huda, M.Pd.I

Jurusan PBA memiliki visi “Menjadi Jurusan terkemuka dan kompetitif di tingkat nasional dalam pengembangan ilmu pendidikan bahasa Arab berwawasan keindonesiaan pada tahun 2036".

Kompetensi Utama Lulusan PBA adalah menjadi Guru bahasa Arab profesional pada tingkat MI/SD, MTs/SMP, MA/SMA/SMK, lembaga pendidikan non formal dan lembaga pelatihan bahasa Arab yang berkepribadian baik, berpengetahuan luas dan mutakhir, berkemampuan dalam melaksanakan tugas pembelajaran yang mendidik dan bertanggung jawab terhadap pelaksanaan tugas berlandaskan etika keilmuan dan profesi.